Czytnik DNA na USB

Urządzenie wyglądające jak popularna pamięć masowa po podłączeniu do laptopa potrafi zbadać DNA w ciągu sekund - informuje "New Scientist".

Obraz
Źródło zdjęć: © Oxford Nanopore Technologies

Zbudowany przez brytyjską firmę Oxford Nanopore MiniION radzi sobie z zsekwencjonowaniem genomu bakterii czy wirusa w ciągu niewielu sekund. Większe genomy wymagają więcej czasu, ale MiniION może również posłużyć do badań próbki komórek podejrzanych o cechy nowotworowe bądź do identyfikacji genetycznej tożsamości zwłok.

Podczas demonstracji - w czasie konferencji Advances in Genome Biology and Technology na Florydzie - udało się zsekwencjonować prostego wirusa PhiX, którego genom składa się z 500. par zasad. Tego akurat wirusa wybrano, ponieważ jego genom był pierwszym genomem, jaki kiedykolwiek udało się zsekwencjonować.

Oxford Nanopore wyprodukowała także większe urządzenie o nazwie GridION do użytku laboratoryjnego. Działa na tej samej zasadzie, co jak MiniION - DNA wprowadzane jest do roztworu zawierającego enzymy, które przyczepiają się do końca każdej z nici. Następnie pod wpływem prądu elektrycznego enzymy i DNA trafiają do setek otworów w membranie na dnie roztworu.

Każdy otwór ma tylko 1. mikrometrów średnicy i umieszczono w nim zmodyfikowaną wersję białka alfa-hemolizyny (AHL), w którego centrum jest pusta, rurkowata przestrzeń o średnicy 10 nanometrów. Gdy DNA wciągane jest do tego otworu, enzym łączy się z AHL i rozdziela dwie nici DNA, przy czym jedna z oddzielonych nici jest wciągana do otworu. Wyjątkowe właściwości elektryczne każdej z zasad zakłócają przepływ prądu przez poszczególne otwory membrany w sposób, który umożliwia ich identyfikację.

Metoda ma dwie ogromne zalety - po pierwsze, nie trzeba powielać DNA, by uzyskać odpowiednią jego ilość, po drugie zaś - można odczytywać fragmenty DNA liczące do 1. 000 jednostek, podczas gdy inne techniki wymagają pocięcia tegoż DNA na krótsze odcinki. Czytnik ma trafić do sprzedaży w tym roku, w cenie 900 dolarów - przystępnej dla większości lekarzy.

Źródło artykułu:
Wybrane dla Ciebie
Cukier na tropie ciemnej materii. Fizyków zaskoczył tani detektor
Cukier na tropie ciemnej materii. Fizyków zaskoczył tani detektor
Usłyszeliśmy narodziny nowych czarnych dziur. To już kolejne pokolenie
Usłyszeliśmy narodziny nowych czarnych dziur. To już kolejne pokolenie
Firma z Izraela i USA chce kontrolować pogodę. Eksperci zaniepokojeni
Firma z Izraela i USA chce kontrolować pogodę. Eksperci zaniepokojeni
Delfin pojawił się w Wenecji. Zachwyca turystów, ale budzi obawy
Delfin pojawił się w Wenecji. Zachwyca turystów, ale budzi obawy
Pancerna potęga NATO. Pierwsze czołgi ALTAY już dostarczone
Pancerna potęga NATO. Pierwsze czołgi ALTAY już dostarczone
Rosjanie chcieli pokonać Ukraińców. Znów strącili własny śmigłowiec
Rosjanie chcieli pokonać Ukraińców. Znów strącili własny śmigłowiec
Nowa broń Rosjan. Nagranie promocyjne ujawnia wady
Nowa broń Rosjan. Nagranie promocyjne ujawnia wady
Nowa broń Pekinu. Kiedyś ta maszyna korzystała z ukraińskich silników
Nowa broń Pekinu. Kiedyś ta maszyna korzystała z ukraińskich silników
Zajrzeli w atmosferę egzoplanety. Ależ gorąco!
Zajrzeli w atmosferę egzoplanety. Ależ gorąco!
Czołgi K2PL ze Śląska. Transfer technologii podpisany
Czołgi K2PL ze Śląska. Transfer technologii podpisany
Zdjęcia ujawniły prawdę. Rosjanie robią to w obwodzie kurskim
Zdjęcia ujawniły prawdę. Rosjanie robią to w obwodzie kurskim
Wlecieli w oko cyklonu. Zastała ich oczekiwana cisza
Wlecieli w oko cyklonu. Zastała ich oczekiwana cisza
ZACZEKAJ! ZOBACZ, CO TERAZ JEST NA TOPIE 🔥